实际经营地址与注册地址不一致并不会完全阻碍企业申请ISO体系认证。但是，企业需要根据自身情况和ISO认证机构的具体要求，做好充分的准备和应对工作，以确保申请过程顺利进行并最终获得认证。
首先，需要明确的是，ISO体系认证更关注的是企业的质量管理体系和实际运营情况，而不仅仅是企业的注册地址。因此，即使企业的实际经营地址与注册地址不一致，只要其能够证明其质量管理体系符合ISO标准，并且实际经营地址有相应的运营证据，那么申请ISO体系认证是完全有可能的。
然而，一些特殊需要资质的行业，要求资质上的地址必须与注册地址和实际经营地址相同。例如，如果企业需要经营许可证（如食品企业），那么其实际经营地址通常需要与注册地址完全一致，否则审核风险会较高。这是因为经营许可证的颁发通常与企业的注册地址和实际经营地址的合规性密切相关。
对于不需要生产经营许可证的普通企业，其注册地址与实际经营地址不一致的情况，提交异地经营说明就可以做iso体系认证。但是，审核机构在审核过程中可能会要求企业提供关于两个地址不一致的合理解释，并验证企业的质量管理体系在实际经营地址是否得到有效实施。
此外，企业还需要提供充分的文件和证据来证明其质量管理体系的有效性和一致性。这些文件和证据可能包括企业的质量手册、程序文件、记录表格、内部审核报告、管理评审报告等。这些材料将有助于审核机构全面了解企业的质量管理体系，并评估其是否符合ISO标准的要求。
